A két, józsefvárosi székhelyű intézmény között hosszú múltra tekint vissza a tudományos-szakmai együttműködés. A mostani megállapodás célja nemcsak az, hogy a múzeum és az egyetem szorosabbra fűzze kapcsolatát, hanem a már kialakult hagyomány eredményeit szeretné hasznosítani.

A múzeum aktív szerepet játszik a jövőben az egyetem régész képzésében: például a szakdolgozatokban való konzulensként, témavezetőként, a doktori programokban. A múzeum saját erőforrásaira támaszkodva, saját helyszínein a tudományos munkatársak átadják tapasztalatukat a hallgatóknak, ezzel is biztosítva a folyamatos, jól képzett utánpótlás szakmai tudását. A múzeum képzési helyként is közreműködik majd; oktatási helyszín lesz, bemutatja a gyűjtés, tárolás, leltározás elméleti és gyakorlati rendszerét, illetve múzeumi gyakorlaton fogadja a hallgatókat. 

A múzeum és az egyetem között létrejövő széleskörű együttműködés erősíti azt a minisztériumi törekvést, hogy a kulturális és az oktatási ágazat minél szorosabban, minél hatékonyabban működjön együtt.